2021년~현재

• 2023.06직제 정비 및 개편(2본부 4부 1센터)
• 2022.07‘인도협력 민간 역량강화’ 수행
• 2022.05‘남북 및 국제사회 대북협력 온라인 소통채널 구축’ 수행
• 2021.10‘한강하구 민간선박 시범항행’ 수행

2011~2020년

• 2020.02직제 정비 및 개편(2본부 5부 1센터)
• 2019.09‘남북교류협력 종합지원센터’ 개소
• 2018.11‘남북공동 유해발굴 자재·장비 지원사업’ 개시
  ‘남북 산림협력사업’ 개시
  ‘한강하구 공동조사사업’ 수행
• 2017.05창립 10주년 기념식 개최
• 2015.07‘대북지원사업 통합관리체계 구축·운영 사업’ 개시
• 2014.04사무실 이전(서울 중구 명동)
• 2012.07직제 정비 및 개편(2실 6팀)
• 2012.01기타공공기관 지정
• 2011.03‘남북관리구역 통행체계 보강사업’ 수행

2010년 이전

• 2009.08‘남북교역·경협 관리 사업’ 개시
• 2008.05‘남북 군사당국간 통신체계 개선사업’ 개시
• 2007.12‘6자회담 대북 에너지 설비·자재 제공사업’ 수행
• 2007.05‘남북 경공업 및 지하자원개발 협력사업’ 남측 이행기구 지정
  '남북교류협력지원협회' 설립(서울 강남구 삼성동)